Det store, rene og lyse gotiske kor i prydes af et stort stenalter, som dog kun ses én gang om året: Langfredag. Resten af året er det dækket af farvestrålende antependier, alterbordforsider, designet af HM Dronning Margrethe II. Se mere under "Dronningens altertekstiler" i menuen til venstre.
 
Stenbordet er fra restaureringen i 1940-erne, men der er i bordpladen indsat en lysere sten, som stammer fra et middelalderligt alterbord.
Alterskaber er i gotisk stil, nyskåret ved restaureringen, så det passer til de nederlandske alabastfigurer fra ca. 1400. Her ses Maria som himmeldronning sammen med Kristus, og de flankeres af seks apostle på hver side.
Krucifikset er er fra ca. 1300 og sidefigurerne Maria og Johannes er fra ca. 1400. 
Selve korset med væksterne er mindelser om "Livets træ". I de fire hjørnefelter ses evangelistsymbolerne.
Alterstagerne: De små er fra ca. 1625 og de store er anskaffet i 1681.
Altersølvet består af flere sæt, bl.a. to senbarokke vinkander, og et helt nyt sæt fremstillet af sølvsmed Michael Weihe, Haderslev.
På alteret ligger Chr. IV's bibel fra 1633, men ved søndagens gudstjenester tages den gamle Chr III's bibel fra 1550 frem. 
 

En omtale af alteret kan læses på http://asp.altertavler.dk/ hvor man kan søge frem til Haderslev Domkirke.